Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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