Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms