Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rprd1bQ9CSU0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rprd1bQ9CSU0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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