Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms