Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms