Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5f1Q9CQQ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms