Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf138Q9CQE0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms