Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NepnQ9CQ76 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms