Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpa3Q9CQ71 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms