Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW3

Mrpl54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl54Q9CPW3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl54Q9CPW3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl54Q9CPW3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms