Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe41Q99PV5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bhlhe41Q99PV5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms