Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrbp1Q99PL5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrbp1Q99PL5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms