Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NsmfQ99NF2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NsmfQ99NF2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms