Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcgf6Q99NA9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcgf6Q99NA9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms