Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atoh8Q99NA2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atoh8Q99NA2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms