Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf2Q99LE6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf2Q99LE6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms