Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99KU6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99KU6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q99KU6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q99KU6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q99KU6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q99KU6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q99KU6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q99KU6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q99KU6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99KU6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99KU6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q99KU6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99KU6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms