Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmp1Q99KU0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmp1Q99KU0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms