Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf34Q99KR6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf34Q99KR6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms