Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep3Q99KK1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms