Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf19Q99KJ5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tcf19Q99KJ5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms