Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn2aQ99KJ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn2aQ99KJ0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms