Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hps4Q99KG7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms