Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnip2Q99JG7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnip2Q99JG7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms