Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psip1Q99JF8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psip1Q99JF8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms