Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Def8Q99J78 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms