Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn16Q925N4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn16Q925N4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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