Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prss28Q924N9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prss28Q924N9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms