Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atpaf2Q91YY4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atpaf2Q91YY4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms