Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm2Q91YD4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm2Q91YD4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm2Q91YD4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm2Q91YD4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm2Q91YD4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpm2Q91YD4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm2Q91YD4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms