Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY5

Pcdhga3, Protocadherin gamma A3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga3Q91XY5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdhga3Q91XY5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhga3Q91XY5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms