Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc115Q8VE99 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc115Q8VE99 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms