Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc36Q8VBW8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms