Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BbxQ8VBW5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BbxQ8VBW5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms