Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc12Q8R344 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms