Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Colec12Q8K4Q8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Colec12Q8K4Q8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms