Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ltbp4Q8K4G1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms