Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5rap2Q8K389 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms