Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssh3Q8K330 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssh3Q8K330 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms