Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccm2Q8K2Y9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms