Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Trappc12Q8K2L8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc12Q8K2L8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trappc12Q8K2L8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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