Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Fcho1Q8K285 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Fcho1Q8K285 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Fcho1Q8K285 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fcho1Q8K285 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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