Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek9Q8K1R7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms