Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn34c1Q8K193 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn34c1Q8K193 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn34c1Q8K193 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn34c1Q8K193 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn34c1Q8K193 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn34c1Q8K193 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn34c1Q8K193 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn34c1Q8K193 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cldn34c1Q8K193 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cldn34c1Q8K193 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cldn34c1Q8K193 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn34c1Q8K193 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cldn34c1Q8K193 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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