Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms