Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fbxo4Q8CHQ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo4Q8CHQ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms