Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Upp2Q8CGR7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms