Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc49a3Q8CE47 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc49a3Q8CE47 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms