Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU5

Efhb, EF-hand domain-containing family member B, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EfhbQ8CDU5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EfhbQ8CDU5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EfhbQ8CDU5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms