Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8CDS7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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